根据2015年3月厦门西部海域游泳动物资源调查资料，对该海域的游泳动物组成特征进行了初步探讨。结果显示，共捕获游泳动物98种，其中鱼类51种、虾类16种、蟹类23种、口足类5种、头足类3种。优势种类有日本蟳（Charybdis japonica）、脊尾白虾（Exopalaemon carinicauda）、凤鲚（Coilia mystus）、叫姑鱼（Johnius belengerii）和哈氏仿对虾（Parapenaeopsis hardwickii）等5种。各站位游泳动物Margalef丰富度指数(D)平均为5.358，Shannon-Wiener多样性指数（H'）平均为2.365，Pielou均匀度指数（J'）平均0.732，平均资源量为307.068 kg∕km2。鱼类、虾类、蟹类、口足类、头足类的资源量分别为192.7、28.8、72.7、7.9、5.0 kg/km2。与历史资料比较，游泳动物的种类和资源量均明显下降，亟需加强渔业资源的管理与保护。

2012年4月、11月，2013年4月、11月，2014年4月先后对连江县黄岐湾海区进行浅海底栖生物调查, 共鉴定出底栖生物10大门类198种, 其中环节动物种类最多，有 121种。五个航次都出现的生物种类只有8种。五个航次调查的浅海底栖生物生物量范围为13.503~27.092g/m2，其中春季为18.142g/m2，秋季为23.079g/m2；栖息密度范围为208.3~2014.7ind/m2，其中春季为1046.0ind/m2，秋季为292.5ind/m2。环节动物、棘皮动物生物量优势度在春、秋季交替出现；环节动物生物密度优势度在春、秋季均占据绝对优势。2012-2014年春、秋季优势种类年间变化较大。在五次调查中，只有2013年有采获经济种类，且种类不多，海区第一优势种均为环节动物多毛类。2012年4月和11月、2013年4月和11月和2014年4月黄岐湾浅海底栖生物物种多样性指数（H′）分别为3.909、3.250、3.780、3.441和4.156，表明调查海区的浅海底栖生物生态环境未受到污染或干扰。